依據(jù)非等位基因相互作用的性質(zhì)可以將它們歸納為：
?、倩パa基因。若干非等位基因只有同時存在時才出現(xiàn)某一性狀，其中任何一個發(fā)生突變時都會導(dǎo)致同一突變型性狀，這些基因稱為互補基因。
?、诋愇伙@性基因。影響同一性狀的兩個非等位基因在一起時，得以表現(xiàn)性狀的基因稱為異位顯性基因或稱上位基因。
③累加基因。對于同一性狀的表型來講，幾個非等位基因中的每一個都只有部分的影響，這樣的幾個基因稱為累加基因或多基因。在累加基因中每一個基因只有較小的一部分表型效應(yīng)，所以又稱為微效基因。相對于微效基因來講，由單個基因決定某一性狀的基因稱為主效基因。
?、苄揎椈颉１旧砭哂谢蛘邲]有任何表型效應(yīng)，可是和另一突變基因同時存在便會影響另一基因的表現(xiàn)程度的基因。如果本身具有同一表型效應(yīng)則和累加基因沒有區(qū)別。
?、菀种苹颉Ｒ粋€基因發(fā)生突變后使另一突變基因的表型效應(yīng)消失而恢復(fù)野生型表型，稱前一基因為后一基因的抑制基因。如果前一基因本身具有表型效應(yīng)則抑制基因和異位顯性基因沒有區(qū)別。
?、拚{(diào)節(jié)基因。一個基因如果對另一個或幾個基因具有阻遏作用或激活作用則稱該基因為調(diào)節(jié)基因。調(diào)節(jié)基因通過對被調(diào)節(jié)的結(jié)構(gòu)基因轉(zhuǎn)錄的控制而發(fā)揮作用。具有阻遏作用的調(diào)節(jié)基因不同于抑制基因，因為抑制基因作用于突變基因而且本身就是突變基因，調(diào)節(jié)基因則作用于野生型基因而且本身也是野生型基因。
?、呶⑿Ф嗷颉Ｓ绊懲恍誀畹幕驗閿?shù)較多，以致無法在雜交子代中明顯地區(qū)分它們的類型，這些基因統(tǒng)稱為微效多基因或稱多基因。
?、啾尘盎蛐?。從理論上看，任何一個基因的作用都要受到同一細胞中其他基因的影響。除了人們正在研究的少數(shù)基因以外，其余的全部基因構(gòu)成所謂的背景基因型或稱殘余基因型。
等位基因的相互作用 1932年H.J.馬勒依據(jù)突變型基因與野生型等位基因的關(guān)系歸納為無效基因、亞效基因、超效基因、新效基因和反效基因。
①無效基因。不能產(chǎn)生野生型表型的、完全失去活性的突變型基因。一般的無效基因卻能通過回復(fù)突變而成為野生型基因。
?、趤喰Щ颉１硇托?yīng)在性質(zhì)上相同于野生型，可是在程度上次于野生型的突變型基因。
?、鄢Щ?。表型效應(yīng)超過野生型等位基因的突變型基因。
?、苄滦Щ?。產(chǎn)生野生型等位基因所沒有的新性狀的突變型基因。
?、莘葱Щ?。作用和野生型等位基因相對抗的突變型基因。
?、掼偳讹@性。對于某一性狀來講，一個等位基因影響身體的一個部分，另一等位基因則影響身體的另一部分，而在雜合體中兩個部分都受到影響的現(xiàn)象稱為鑲嵌顯性。
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