APOBEC3 基因缺失增加乳腺癌發(fā)病風(fēng)險
目前很少有研究評估拷貝數(shù)變異(CNV)情況、其他重要的基因變異情況與乳腺癌發(fā)病風(fēng)險之間的聯(lián)系。來自美國納什維爾 Vanderbilt 大學(xué)醫(yī)學(xué)院的 Jirong Long 等針對上述問題進(jìn)行了相關(guān)研究,他們的研究結(jié)果發(fā)表在 JNCI 2 月最新的在線期刊上。
研究分為兩個階段。在 2623 名乳腺癌患者和 1946 名對照組患者中,研究者采用 Affymetrix SNP Array 6.0 進(jìn)行了 CNV GWAS 研究(第一階段)。然后他們在另一個獨立的由 4254 名患者人群和 4387 名對照人群入組的研究中,采用實時定量聚合酶鏈反應(yīng)(qPCR)對最可能存在的 CNV 進(jìn)行擴(kuò)增(第二階段)。所有的受試者數(shù)據(jù)都來自于在上海女性中進(jìn)行的基于人口的相關(guān)研究。
在第一階段調(diào)查的 268 個常見 CNVs(最小等位基因頻率≥5%)中,研究者發(fā)現(xiàn)最強(qiáng)的聯(lián)系存在于 APOBEC3 基因的廣泛缺失,所以在第二階段研究者們擴(kuò)增了上述基因(優(yōu)勢比 1.35,95% 可信區(qū)間 1.27 至 1.44)。應(yīng)用 qPCR 對兩個階段的所有樣本進(jìn)行分析,結(jié)果提示一個拷貝缺失的優(yōu)勢比為 1.31(95% 可信區(qū)間 1.21 至 1.42),兩個拷貝缺失的優(yōu)勢比為 1.76(95% 可信區(qū)間 1.57 至 1.97)。
本研究結(jié)果以令人信服的證據(jù)提示 APOBEC3 基因序列中存在與乳腺癌發(fā)病相關(guān)的一個新的位點。至今為止,對于乳腺癌的發(fā)病風(fēng)險而言,CNV 是可確定的相關(guān)度最大的遺傳風(fēng)險變量。